يضم المتحف حوالي 16000 عمل فني - أكبر مجموعة من القطع الأثرية القبطية في العالم - بما في ذلك المخطوطات والأيقونات والأعمال الخشبية المنحوتة واللوحات الجدارية ذات الطابع الديني من الكنائس والأديرة القديمة.